Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD40LGP29965 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD40LGP29965 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms