Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP1P23763 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms