Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPREP23469 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPREP23469 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPREP23469 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPREP23469 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPREP23469 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPREP23469 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPREP23469 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPREP23469 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPREP23469 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPREP23469 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPREP23469 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPREP23469 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPREP23469 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPREP23469 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPREP23469 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPREP23469 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPREP23469 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPREP23469 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPREP23469 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPREP23469 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPREP23469 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPREP23469 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPREP23469 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPREP23469 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPREP23469 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPREP23469 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPREP23469 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPREP23469 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPREP23469 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPREP23469 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPREP23469 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPREP23469 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPREP23469 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPREP23469 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPREP23469 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPREP23469 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPREP23469 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPREP23469 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPREP23469 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPREP23469 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPREP23469 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPREP23469 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPREP23469 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPREP23469 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPREP23469 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPREP23469 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPREP23469 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPREP23469 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPREP23469 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPREP23469 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPREP23469 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPREP23469 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPREP23469 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPREP23469 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPREP23469 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPREP23469 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPREP23469 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPREP23469 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPREP23469 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPREP23469 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPREP23469 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPREP23469 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPREP23469 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPREP23469 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPREP23469 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPREP23469 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPREP23469 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPREP23469 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPREP23469 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPREP23469 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPREP23469 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPREP23469 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPREP23469 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPREP23469 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPREP23469 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPREP23469 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPREP23469 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPREP23469 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPREP23469 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPREP23469 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPREP23469 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPREP23469 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPREP23469 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPREP23469 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPREP23469 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPREP23469 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPREP23469 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPREP23469 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPREP23469 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPREP23469 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPREP23469 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPREP23469 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPREP23469 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPREP23469 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPREP23469 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPREP23469 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPREP23469 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPREP23469 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPREP23469 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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