Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GCSHP23434 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GCSHP23434 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GCSHP23434 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
GCSHP23434 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GCSHP23434 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GCSHP23434 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GCSHP23434 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GCSHP23434 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GCSHP23434 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GCSHP23434 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GCSHP23434 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
GCSHP23434 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GCSHP23434 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GCSHP23434 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GCSHP23434 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GCSHP23434 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GCSHP23434 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GCSHP23434 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GCSHP23434 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GCSHP23434 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GCSHP23434 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GCSHP23434 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GCSHP23434 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GCSHP23434 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GCSHP23434 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GCSHP23434 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GCSHP23434 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GCSHP23434 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GCSHP23434 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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GCSHP23434 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCSHP23434 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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