Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HRCP23327 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HRCP23327 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HRCP23327 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HRCP23327 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HRCP23327 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HRCP23327 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HRCP23327 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HRCP23327 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HRCP23327 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HRCP23327 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HRCP23327 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HRCP23327 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
HRCP23327 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HRCP23327 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HRCP23327 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HRCP23327 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HRCP23327 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HRCP23327 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HRCP23327 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HRCP23327 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
HRCP23327 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HRCP23327 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HRCP23327 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HRCP23327 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HRCP23327 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HRCP23327 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HRCP23327 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HRCP23327 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HRCP23327 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HRCP23327 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HRCP23327 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HRCP23327 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HRCP23327 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HRCP23327 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HRCP23327 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HRCP23327 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HRCP23327 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HRCP23327 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HRCP23327 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HRCP23327 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HRCP23327 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
HRCP23327 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HRCP23327 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HRCP23327 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HRCP23327 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HRCP23327 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HRCP23327 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HRCP23327 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HRCP23327 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HRCP23327 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
HRCP23327 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HRCP23327 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HRCP23327 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
HRCP23327 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HRCP23327 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HRCP23327 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HRCP23327 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HRCP23327 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HRCP23327 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HRCP23327 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HRCP23327 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HRCP23327 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
HRCP23327 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
HRCP23327 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HRCP23327 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HRCP23327 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HRCP23327 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HRCP23327 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HRCP23327 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HRCP23327 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
HRCP23327 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HRCP23327 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HRCP23327 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HRCP23327 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HRCP23327 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HRCP23327 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HRCP23327 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HRCP23327 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HRCP23327 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HRCP23327 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HRCP23327 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HRCP23327 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HRCP23327 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HRCP23327 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HRCP23327 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HRCP23327 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HRCP23327 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HRCP23327 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HRCP23327 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HRCP23327 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HRCP23327 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HRCP23327 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HRCP23327 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HRCP23327 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HRCP23327 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HRCP23327 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HRCP23327 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HRCP23327 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HRCP23327 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms