Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NF1P21359 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NF1P21359 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NF1P21359 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NF1P21359 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NF1P21359 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NF1P21359 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NF1P21359 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.05■□□□□ 0
NF1P21359 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
NF1P21359 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NF1P21359 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
NF1P21359 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NF1P21359 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NF1P21359 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NF1P21359 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NF1P21359 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NF1P21359 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NF1P21359 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NF1P21359 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NF1P21359 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NF1P21359 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NF1P21359 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NF1P21359 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NF1P21359 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NF1P21359 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NF1P21359 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NF1P21359 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NF1P21359 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NF1P21359 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NF1P21359 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NF1P21359 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NF1P21359 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NF1P21359 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NF1P21359 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NF1P21359 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NF1P21359 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NF1P21359 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NF1P21359 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NF1P21359 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NF1P21359 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NF1P21359 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NF1P21359 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NF1P21359 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NF1P21359 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NF1P21359 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NF1P21359 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NF1P21359 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NF1P21359 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NF1P21359 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NF1P21359 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NF1P21359 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NF1P21359 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NF1P21359 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NF1P21359 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NF1P21359 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NF1P21359 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NF1P21359 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NF1P21359 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NF1P21359 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NF1P21359 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NF1P21359 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NF1P21359 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NF1P21359 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NF1P21359 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NF1P21359 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NF1P21359 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NF1P21359 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NF1P21359 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NF1P21359 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NF1P21359 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NF1P21359 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NF1P21359 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms