Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP4AP20648 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms