Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPI1P17947 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPI1P17947 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPI1P17947 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPI1P17947 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPI1P17947 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPI1P17947 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPI1P17947 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPI1P17947 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPI1P17947 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPI1P17947 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPI1P17947 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPI1P17947 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPI1P17947 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPI1P17947 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPI1P17947 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPI1P17947 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPI1P17947 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPI1P17947 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPI1P17947 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPI1P17947 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPI1P17947 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SPI1P17947 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPI1P17947 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPI1P17947 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPI1P17947 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SPI1P17947 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPI1P17947 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPI1P17947 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPI1P17947 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPI1P17947 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPI1P17947 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPI1P17947 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPI1P17947 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPI1P17947 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPI1P17947 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPI1P17947 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPI1P17947 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPI1P17947 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPI1P17947 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPI1P17947 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPI1P17947 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPI1P17947 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPI1P17947 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPI1P17947 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPI1P17947 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPI1P17947 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPI1P17947 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPI1P17947 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPI1P17947 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPI1P17947 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPI1P17947 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPI1P17947 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPI1P17947 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPI1P17947 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPI1P17947 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPI1P17947 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPI1P17947 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPI1P17947 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPI1P17947 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPI1P17947 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPI1P17947 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPI1P17947 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPI1P17947 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPI1P17947 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPI1P17947 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms