Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GTF2F2P13984 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms