Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LYL1P12980 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYL1P12980 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYL1P12980 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYL1P12980 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYL1P12980 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYL1P12980 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYL1P12980 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYL1P12980 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYL1P12980 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYL1P12980 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYL1P12980 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYL1P12980 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LYL1P12980 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYL1P12980 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYL1P12980 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYL1P12980 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYL1P12980 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYL1P12980 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LYL1P12980 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYL1P12980 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYL1P12980 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LYL1P12980 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYL1P12980 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYL1P12980 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYL1P12980 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYL1P12980 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LYL1P12980 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYL1P12980 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYL1P12980 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYL1P12980 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYL1P12980 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LYL1P12980 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LYL1P12980 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LYL1P12980 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LYL1P12980 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LYL1P12980 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LYL1P12980 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LYL1P12980 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LYL1P12980 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms