Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAMP11215 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms