Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LAMC1P11047 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMC1P11047 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms