Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I0

USP17L8, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L8P0C7I0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L8P0C7I0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms