Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms