Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACAA1P09110 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms