Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFMP07197 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFMP07197 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFMP07197 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFMP07197 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFMP07197 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFMP07197 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFMP07197 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFMP07197 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFMP07197 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFMP07197 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFMP07197 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFMP07197 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFMP07197 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFMP07197 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFMP07197 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEFMP07197 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFMP07197 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFMP07197 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFMP07197 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFMP07197 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFMP07197 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFMP07197 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFMP07197 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFMP07197 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFMP07197 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFMP07197 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFMP07197 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFMP07197 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFMP07197 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFMP07197 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFMP07197 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFMP07197 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFMP07197 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEFMP07197 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFMP07197 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFMP07197 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFMP07197 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFMP07197 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFMP07197 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFMP07197 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFMP07197 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFMP07197 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFMP07197 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFMP07197 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFMP07197 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFMP07197 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFMP07197 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFMP07197 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFMP07197 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFMP07197 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFMP07197 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFMP07197 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFMP07197 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFMP07197 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEFMP07197 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFMP07197 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFMP07197 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFMP07197 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFMP07197 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFMP07197 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFMP07197 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFMP07197 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFMP07197 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFMP07197 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFMP07197 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFMP07197 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFMP07197 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFMP07197 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFMP07197 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFMP07197 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFMP07197 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFMP07197 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFMP07197 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFMP07197 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFMP07197 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFMP07197 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFMP07197 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEFMP07197 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFMP07197 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFMP07197 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFMP07197 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFMP07197 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFMP07197 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFMP07197 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFMP07197 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFMP07197 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFMP07197 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFMP07197 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFMP07197 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFMP07197 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFMP07197 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFMP07197 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFMP07197 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFMP07197 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFMP07197 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFMP07197 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFMP07197 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFMP07197 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEFMP07197 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms