Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC45O75419 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC45O75419 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC45O75419 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC45O75419 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC45O75419 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC45O75419 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC45O75419 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC45O75419 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC45O75419 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC45O75419 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC45O75419 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC45O75419 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC45O75419 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC45O75419 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC45O75419 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC45O75419 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC45O75419 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC45O75419 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC45O75419 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC45O75419 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC45O75419 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC45O75419 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC45O75419 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC45O75419 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC45O75419 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC45O75419 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC45O75419 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC45O75419 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC45O75419 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC45O75419 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC45O75419 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC45O75419 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC45O75419 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC45O75419 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC45O75419 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC45O75419 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC45O75419 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC45O75419 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC45O75419 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC45O75419 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC45O75419 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC45O75419 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC45O75419 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC45O75419 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC45O75419 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC45O75419 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC45O75419 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC45O75419 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC45O75419 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC45O75419 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC45O75419 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC45O75419 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC45O75419 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC45O75419 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC45O75419 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC45O75419 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC45O75419 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC45O75419 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC45O75419 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC45O75419 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC45O75419 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC45O75419 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC45O75419 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC45O75419 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC45O75419 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC45O75419 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC45O75419 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC45O75419 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC45O75419 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC45O75419 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC45O75419 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC45O75419 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC45O75419 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC45O75419 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC45O75419 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC45O75419 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC45O75419 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC45O75419 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC45O75419 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC45O75419 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC45O75419 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC45O75419 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC45O75419 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC45O75419 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC45O75419 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC45O75419 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC45O75419 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC45O75419 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC45O75419 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDC45O75419 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDC45O75419 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDC45O75419 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDC45O75419 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CDC45O75419 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDC45O75419 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC45O75419 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC45O75419 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC45O75419 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC45O75419 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms