Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX3O75364 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX3O75364 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX3O75364 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX3O75364 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX3O75364 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX3O75364 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX3O75364 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX3O75364 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX3O75364 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX3O75364 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX3O75364 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX3O75364 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX3O75364 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX3O75364 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX3O75364 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX3O75364 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX3O75364 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX3O75364 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PITX3O75364 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX3O75364 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX3O75364 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX3O75364 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX3O75364 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX3O75364 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX3O75364 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX3O75364 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX3O75364 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX3O75364 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX3O75364 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX3O75364 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX3O75364 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX3O75364 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX3O75364 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX3O75364 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX3O75364 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX3O75364 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX3O75364 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX3O75364 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX3O75364 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX3O75364 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX3O75364 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX3O75364 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX3O75364 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX3O75364 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX3O75364 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX3O75364 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PITX3O75364 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITX3O75364 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX3O75364 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX3O75364 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX3O75364 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX3O75364 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms