Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT3O75175 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms