Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms