Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DHX16O60231 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DHX16O60231 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DHX16O60231 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DHX16O60231 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DHX16O60231 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DHX16O60231 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX16O60231 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX16O60231 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX16O60231 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX16O60231 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX16O60231 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX16O60231 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX16O60231 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX16O60231 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX16O60231 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX16O60231 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX16O60231 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX16O60231 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX16O60231 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX16O60231 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX16O60231 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX16O60231 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX16O60231 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX16O60231 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX16O60231 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX16O60231 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX16O60231 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX16O60231 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHX16O60231 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHX16O60231 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHX16O60231 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHX16O60231 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHX16O60231 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHX16O60231 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHX16O60231 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHX16O60231 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHX16O60231 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHX16O60231 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHX16O60231 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHX16O60231 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHX16O60231 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHX16O60231 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHX16O60231 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHX16O60231 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHX16O60231 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHX16O60231 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHX16O60231 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHX16O60231 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHX16O60231 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHX16O60231 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHX16O60231 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHX16O60231 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHX16O60231 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DHX16O60231 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHX16O60231 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHX16O60231 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHX16O60231 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DHX16O60231 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DHX16O60231 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DHX16O60231 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHX16O60231 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHX16O60231 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHX16O60231 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHX16O60231 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHX16O60231 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX16O60231 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX16O60231 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX16O60231 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX16O60231 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX16O60231 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX16O60231 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX16O60231 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX16O60231 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX16O60231 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX16O60231 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX16O60231 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX16O60231 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX16O60231 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX16O60231 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX16O60231 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX16O60231 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX16O60231 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX16O60231 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX16O60231 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX16O60231 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX16O60231 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX16O60231 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX16O60231 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX16O60231 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX16O60231 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX16O60231 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX16O60231 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX16O60231 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX16O60231 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX16O60231 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DHX16O60231 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DHX16O60231 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DHX16O60231 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DHX16O60231 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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