Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENRO43583 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENRO43583 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENRO43583 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENRO43583 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENRO43583 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENRO43583 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENRO43583 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENRO43583 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENRO43583 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENRO43583 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENRO43583 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DENRO43583 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENRO43583 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENRO43583 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENRO43583 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENRO43583 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENRO43583 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENRO43583 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENRO43583 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENRO43583 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENRO43583 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENRO43583 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENRO43583 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENRO43583 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENRO43583 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENRO43583 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENRO43583 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENRO43583 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENRO43583 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENRO43583 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENRO43583 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENRO43583 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENRO43583 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENRO43583 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENRO43583 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENRO43583 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENRO43583 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENRO43583 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENRO43583 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENRO43583 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENRO43583 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENRO43583 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENRO43583 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENRO43583 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENRO43583 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENRO43583 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DENRO43583 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENRO43583 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENRO43583 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENRO43583 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENRO43583 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENRO43583 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENRO43583 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENRO43583 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENRO43583 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENRO43583 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENRO43583 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENRO43583 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENRO43583 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENRO43583 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENRO43583 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENRO43583 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENRO43583 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENRO43583 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENRO43583 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENRO43583 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENRO43583 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENRO43583 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENRO43583 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENRO43583 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENRO43583 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENRO43583 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENRO43583 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENRO43583 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENRO43583 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENRO43583 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENRO43583 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENRO43583 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENRO43583 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENRO43583 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENRO43583 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms