Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR1CO15160 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms