Protein–RNA interactions for Protein: O15015

ZNF646, Zinc finger protein 646, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF646O15015 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF646O15015 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF646O15015 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms