Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HIP1O00291 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIP1O00291 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIP1O00291 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIP1O00291 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIP1O00291 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIP1O00291 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIP1O00291 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIP1O00291 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIP1O00291 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIP1O00291 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIP1O00291 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIP1O00291 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIP1O00291 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIP1O00291 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIP1O00291 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIP1O00291 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIP1O00291 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIP1O00291 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIP1O00291 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIP1O00291 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms