Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DFFAO00273 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DFFAO00273 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DFFAO00273 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DFFAO00273 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DFFAO00273 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DFFAO00273 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DFFAO00273 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DFFAO00273 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DFFAO00273 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DFFAO00273 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DFFAO00273 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DFFAO00273 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DFFAO00273 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DFFAO00273 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DFFAO00273 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DFFAO00273 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DFFAO00273 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DFFAO00273 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DFFAO00273 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DFFAO00273 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DFFAO00273 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DFFAO00273 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DFFAO00273 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DFFAO00273 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DFFAO00273 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DFFAO00273 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DFFAO00273 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DFFAO00273 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DFFAO00273 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DFFAO00273 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DFFAO00273 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DFFAO00273 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DFFAO00273 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DFFAO00273 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DFFAO00273 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DFFAO00273 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DFFAO00273 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DFFAO00273 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DFFAO00273 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DFFAO00273 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DFFAO00273 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DFFAO00273 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DFFAO00273 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DFFAO00273 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DFFAO00273 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DFFAO00273 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DFFAO00273 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DFFAO00273 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DFFAO00273 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DFFAO00273 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DFFAO00273 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DFFAO00273 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms