Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms