Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NOTOA8MTQ0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms