Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC162PA2VCL2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC162PA2VCL2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC162PA2VCL2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC162PA2VCL2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC162PA2VCL2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC162PA2VCL2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC162PA2VCL2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC162PA2VCL2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC162PA2VCL2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC162PA2VCL2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC162PA2VCL2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC162PA2VCL2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC162PA2VCL2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC162PA2VCL2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC162PA2VCL2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC162PA2VCL2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC162PA2VCL2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC162PA2VCL2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC162PA2VCL2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC162PA2VCL2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC162PA2VCL2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC162PA2VCL2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms