Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms