Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6N4

TRBV25-1, T-cell receptor beta variable 25-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV25-1A0A075B6N4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms