Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00312Q9Y6C7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms