Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AUP1Q9Y679 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms