Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG4BQ9Y4P1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG4BQ9Y4P1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms