Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms