Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms