Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA11Q9UKX5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms