Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MBD1Q9UIS9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MBD1Q9UIS9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MBD1Q9UIS9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MBD1Q9UIS9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MBD1Q9UIS9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MBD1Q9UIS9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MBD1Q9UIS9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MBD1Q9UIS9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MBD1Q9UIS9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MBD1Q9UIS9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MBD1Q9UIS9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MBD1Q9UIS9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MBD1Q9UIS9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MBD1Q9UIS9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MBD1Q9UIS9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MBD1Q9UIS9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MBD1Q9UIS9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MBD1Q9UIS9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MBD1Q9UIS9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MBD1Q9UIS9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MBD1Q9UIS9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MBD1Q9UIS9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MBD1Q9UIS9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MBD1Q9UIS9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MBD1Q9UIS9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MBD1Q9UIS9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MBD1Q9UIS9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms