Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATPIF1Q9UII2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms