Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NPC1L1Q9UHC9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPC1L1Q9UHC9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms