Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.56
POLKQ9UBT6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms