Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL42Q9P2K6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL42Q9P2K6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms