Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM4

BICRA, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICRAQ9NZM4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC34.46■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
BICRAQ9NZM4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BICRAQ9NZM4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms