Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TVP23BQ9NYZ1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TVP23BQ9NYZ1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TVP23BQ9NYZ1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TVP23BQ9NYZ1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TVP23BQ9NYZ1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TVP23BQ9NYZ1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TVP23BQ9NYZ1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TVP23BQ9NYZ1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TVP23BQ9NYZ1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23BQ9NYZ1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23BQ9NYZ1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23BQ9NYZ1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23BQ9NYZ1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23BQ9NYZ1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23BQ9NYZ1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23BQ9NYZ1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23BQ9NYZ1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23BQ9NYZ1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23BQ9NYZ1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23BQ9NYZ1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23BQ9NYZ1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23BQ9NYZ1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23BQ9NYZ1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23BQ9NYZ1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23BQ9NYZ1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23BQ9NYZ1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23BQ9NYZ1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23BQ9NYZ1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TVP23BQ9NYZ1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms