Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MIS18AQ9NYP9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MIS18AQ9NYP9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms