Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM53CQ9NYF3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms