Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AL392088.1-201ENST00000428364 670 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AC099542.2-201ENST00000474149 553 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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