Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDL2Q9NX52 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms