Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLE1Q9NVX2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms