Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP7BPQ9NSQ0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP7BPQ9NSQ0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP7BPQ9NSQ0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP7BPQ9NSQ0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP7BPQ9NSQ0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP7BPQ9NSQ0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP7BPQ9NSQ0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP7BPQ9NSQ0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP7BPQ9NSQ0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP7BPQ9NSQ0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP7BPQ9NSQ0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP7BPQ9NSQ0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP7BPQ9NSQ0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP7BPQ9NSQ0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP7BPQ9NSQ0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms